Когато отминаха времената на езичеството, когато християнството престана да бъде преследвано и беше признато за световна религия, изглежда, че всички различия трябва да бъдат разрешени. Но понякога само Вселенските събори можеха да разрешават възникващи конфликти, да отхвърлят еретичните учения - нямаше мир дори в Църквата.
Първият вселенски събор е Никейският събор, свикан през 325 г. Причината за това е широко разпространеното учение на александрийския презвитер Арий. Същността му беше да отрича идентичността между Бог Отец и Бог Син. Той твърди, че Исус Христос е създаден от Господ, но не е негово въплъщение. Такава идея фундаментално опроверга всички догми на християнството и затова първоначално учението на Арий беше отхвърлено от Местния събор. Гордият презвитер обаче отказва да признае решението на Съвета за легитимно и продължава да печели вярващите.
Тогава император Константин покани епископи от цял свят на Вселенския събор в малкия град Никея (сега наричан Изник и намиращ се на територията на съвременна Турция). Някои от присъстващите представители на Църквата носеха следи от изтезания по телата си,приети в името на истинското християнство. Присъстваха и епископи, подкрепящи Арий.
Дебатът продължи повече от два месеца. През това време имаше много дискусии, речи на философи, уточнения на богословски постановки. Както разказва легендата, проявата на божествено чудо сложи край на пререкания. Като единство от три принципа той даде пример за глинено парче: вода, огън, глина дават едно цяло. По същия начин Светата Троица е по същество един Бог. След речта му се появи огън от черепа, появи се вода и се образува глина. След такова чудо, Никейският събор окончателно отхвърли лъжовното учение на Арий, отлъчи го от Църквата, одобри Символа на вярата и установи 20 правила на църковната дисциплина, определи датата за празнуване на Великден..
Но този църковен съвет не сложи край на този въпрос. Спорът продължи много дълго време. Дори и сега тяхното ехо все още се чува - арианството е в основата на учението на Свидетелите на Йехова.
В допълнение към събора от 325 г. имаше и Вторият Никейски събор, свикан от Константинополска императрица Ирина през 787 г. Целта му е да премахне съществуващото по това време иконоборство. Всъщност императрицата прави два опита да свика Вселенски събор. Но през 786 г. стражите, подкрепящи иконоборците, нахлуват в храма на светите апостоли в Константинопол, където започва работа Съборът. Светите отци трябваше да се разпръснат.
Прибягвайки до значителни трикове, разпускане на старата гвардия, набиране на нови войски, Ирина все пак свиква катедралата в787 г., но го премества от Константинопол в Никея. Работата му продължи един месец, след резултатите от нея почитането на иконите беше възстановено, те бяха разрешени в църкви.
Въпреки това, дори този съвет в Никея не успя да постигне напълно своята цел. Иконоборството продължава да съществува. Иконоборското движение е окончателно победено едва през 843 г. на Константинополския събор.
